Como você já tem uma unidade de destino para o seu sistema operacional, @ntgCleaner, você deve desconectar todos os dispositivos SATA secundários conectados à placa-mãe enquanto o Windows estiver instalando. Ter mais de 1 unidade de destino no seu sistema provavelmente confunde a instalação do Windows. Desconectar as unidades secundárias também impediria que você encontrasse a chamada Confusão do SO.
Depois de ter instalado com êxito o sistema operacional Windows no SSD principal / de inicialização, conecte novamente as unidades secundárias e reformate-as por meio do Gerenciamento de disco, se necessário. Você também pode encontrar este Windows Install & Guia de otimização para SSDs e amp; HDDs bastante útil.
Espero que isso ajude você. :) Boa sorte!