Eu não tenho nenhuma explicação racional para o porquê, mas eu tive o ClassicShell instalado. Eu notei que estava sendo acessado na pilha para todas as instâncias do CreateFile, então, em um palpite desfeito, eu desinstalei o ClassicShell e o comportamento parou; o Process Monitor está limpo há dias.
Obrigado a todos pela ajuda.