Para redirecionar a saída remota para um único arquivo
ssh [email protected] '(script or command)' > ./local_filename
Para vários arquivos, percorra uma lista de servidores e logins. Se eles tiverem um ticket Kerberos comum ou uma autenticação semelhante, o processo será mais simples. E acrescente um contador ao nome do arquivo ./local_filename_count
Para mais detalhes: link