Em setupcomplete.cmd, você pode tentar implementar cd %~dp0 seguido por cd .. ou pushd .. . Isso deve aumentar um nível e você pode trabalhar com nomes de caminho variáveis.
Se você quiser apenas copiar arquivos / pastas, poderá colocá-los em [DVD]:\sources\$OEM$\\[*] , em que [*] é a pasta que você quer que seja o destino.
Por exemplo você deseja copiar a pasta ABC para a configuração C:\Program Files\ while (ou depois? não sei mais), coloque a pasta ABC em [DVD]:\sources\$OEM$\\Program Files\ .
$$ significa C:\Windows\
$1 significa C:\ (raiz da unidade)