Essa mensagem é normalmente exibida pelo Shim quando o sistema está configurado com o Secure Boot desativado. Eu pareço lembrar que ele está sendo exibido com erro em pelo menos um sistema, mas não me lembro dos detalhes. Se isto é o que está acontecendo, você não vai se livrar da mensagem, então você deve simplesmente aprender a viver com ela - pelo menos, a menos que e até que um binário de Shim atualizado seja lançado, que corrija o problema.
Você pode querer verificar o seu modo de inicialização segura no Ubuntu, no entanto. Você pode fazer isso da seguinte maneira:
$ hexdump /sys/firmware/efi/efivars/SecureBoot-8be4df61-93ca-11d2-aa0d-00e098032b8c
0000000 0016 0000 0001
0000005
A primeira linha de saída mostra o valor da variável SecureBoot do EFI. Nesse caso, ele termina em 0001 , o que indica que a inicialização segura está ativa. Se ele ler 0000 , significa que está inativo. Se você obtiver um erro No such file or directory , isso significa que o sistema não suporta Inicialização Segura (ou talvez que é suportado, mas nunca esteve ativo), que é efetivamente o mesmo que ser inativo.
Se a própria interface do firmware diz que o Secure Boot está ativo mas inativo no Ubuntu, isso sugere um problema em algum lugar. Eu sei que algumas versões recentes do Shim têm uma maneira de efetivamente ignorar o Secure Boot se elas estiverem configuradas de uma certa maneira, então isso pode ser o que está acontecendo; mas eu preciso cavar um pouco mais para descobrir o que é esse recurso ou como verificar ou reconfigurá-lo.