System em Healthy(...) de G: provavelmente indicou que é a partição "ativa" (ou seja, o bootmgr é usado), e é por isso que você não pode excluí-la.
Para confirmar isso, você pode verificar com detail partition em diskpart ou bcdedit .
Por exemplo,
diskpart
select disk 0
select partition 2
detail partition
Ele deve informar Active: Yes .
bcdedit deve mostrar que device é partition=G: na seção Windows Boot Manager .
Para corrigir isso, você pode usar active em diskpart para marcar o C: como ativo.
Por exemplo,
diskpart
select disk 0
select partition 1
active
É melhor você certificar-se de que C: tenha um conjunto de bootloader ( bootmgr , BCD Store ...) antes de reinicializar:
bcdboot C:\Windows /s C: /f BIOS
( link )
Após a reinicialização, você verá que System em Healthy(...) de G: foi movido para C: e poderá excluir G: .
P.S. O Boot mostrado em Healthy(...) no Gerenciamento de Disco significa apenas bootmgr inicializou o \Windows nessa partição. Não tem nada a ver com a partição "ativa" mencionada acima.