Aqui está uma fórmula única que funciona:
=SUM(IF($B$1,INDIRECT($A$1 & ".C1"),0), IF($B$2,INDIRECT($A$2 & ".C1"),0))
Isso lida com os dois primeiros arquivos. Para mais arquivos, adicione outra cláusula IF
para cada arquivo.
No entanto, acho que seria mais fácil criar "colunas inúteis" e, em seguida, SUMIF . O uso de células adicionais para cálculos é o objetivo das planilhas.