crie um arquivo XML personalizado com o seguinte conteúdo para excluir a unidade C:
<migration urlid="http://www.microsoft.com/migration/1.0/migxmlext/allfiles">
<component type="Documents" context="System">
<displayName>Test</displayName>
<role role="Data">
<rules>
<unconditionalExclude>
<objectSet>
<pattern type="File">c:\*[*]</pattern>
</objectSet>
</unconditionalExclude>
</rules>
</role>
</component>
</migration>