A solução acabou sendo tão simples e barata como mudar o Default Gateway distribuído pelo servidor DHCP para o IP do Raspberry Pi.
Em seguida, configurar o IPTables do Pi com as seguintes opções
sudo iptables -t nat -A PREROUTING -p tcp --dport 21 -j REDIRECT --to-port 3128
sudo iptables -t nat -A PREROUTING -p tcp --dport 80 -j REDIRECT --to-port 3128
sudo iptables -t nat -A PREROUTING -p tcp --dport 443 -j REDIRECT --to-port 3130