Acontece que o vinho não ouve realmente quais mapeamentos eu configurei no sistema operacional (usando as configurações do sistema), mas sim vê o xkb. Faz sentido que eu não tenha pensado nisso a princípio.
No entanto, posso forçá-lo ao mapeamento dos EUA, o que irá, de alguma forma, resolver o meu problema, no entanto, não posso usar o layout SE. Então descobri que posso usar vários layouts como:
setxkbmap -layout "us,se"
O que funcionou para mim, agora eu posso fazer uso dos layouts também em monodesenvolvimento.