Faça o logout da sua sessão, abra um tty.
Pare o serviço de sessão gráfica. No Ubuntu é lightdm , o Gnome é gdm , o Mint é mdn . Não é necessário digitar o que depois do # é apenas um comentário.
sudo service stop lightdm #Change service accordingly
sudo apt-get purge nvidia* bumblebee primus #Delete all nvidia installed libs
sudo apt-get autoremove #Delete unneeded packages
sudo add-apt-repository -y ppa:xorg-edgers/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install nvidia-346 nvidia-settings ppa-purge #Install new nvidia driver
Reinicie a sua máquina, se tudo estiver bem, faça o login. Abra o 'NVIDIA Settings' e escolha a GPU que preferir. Infelizmente o bumblebee não está funcionando com esta versão do driver ou ainda estou tentando encontrar uma maneira de fazê-lo funcionar. No seu caso, é o que você pediu, apenas uma GPU será ativada.
Se nenhuma sessão gráfica for iniciada, você terá que remover o driver.
sudo ppa-purge ppa:xorg-edgers/ppa
sudo apt-get remove nvidia-346
Reinicialize novamente, nouveau assumirá, reinstale os drivers anteriores.