Postando o que eu fiz porque há muitas maneiras para que isso aconteça e alguém pode estar procurando pela minha combinação única de fatores.
- Os arquivos do disco rígido foram danificados, mas a própria unidade não teve problemas, se o chkdsk e outras ferramentas de verificação do disco rígido forem indicativos. Eu acho que isso aconteceu quando eu removi a unidade enquanto desmontava a máquina e a colocava na minha cama. Arquivos aleatórios estavam faltando, incluindo arquivos necessários da partição de recuperação.
- Como a partição de recuperação estava inativa, não havia como "atualizar" ou "reparar" usando as ferramentas internas do Vaio.
- Eu tentei as seguintes opções de linha de comando e nenhuma delas ajudou: sfc / scannow, bootrec / fixboot, bootrec / fixmbr, SFCFix.exe seguido por sfc / scannow. Tente todos esses comandos, porque, em muitos casos, eles podem resolver seu problema. Outras pessoas acham que usar o bcdboot para reconstruir o setor de inicialização e apontá-lo para o local certo ajuda (Google para mais informações). No meu caso, nada disso funcionou.
- Como o disco rígido ainda estava funcionando, mas os dados estavam confusos, consegui usar uma unidade flash USB para recuperar a maioria dos arquivos que precisava manter.
- Eu fiz uma instalação limpa do Windows, limpando todas as partições que já estavam no disco no processo.
Espero que isso seja útil para outra pessoa no futuro.