O problema é que as VMs são executadas usando um aplicativo diferente, um contido no VirtualBox.app. A caixa de diálogo Adicionar aplicativo não permite que você navegue mais fundo no arquivo .app (como normalmente faria usando "Mostrar conteúdo do pacote" no Finder).
Uma solução para isso é criar um link simbólico para o aplicativo que está executando VMs. Aqui está um exemplo de comando (que você executaria no console) que conseguiria isso:
ln -s /Applications/VirtualBox.app/Contents/Resources/VirtualBoxVM.app ~/Applications/VirtualBoxVM.app
Isso cria um link simbólico na sua pasta de Aplicativos pessoais. Agora, no IntelliType, você navega até a sua própria pasta Aplicativos e seleciona o aplicativo VirtualBoxVM.