Talvez eu esteja entendendo mal sua pergunta, mas parece semelhante a essa pergunta: Altera o atalho de teclado para alternar aplicativos no OS X
Parece que você quer KeyRemap4Macbook , que agora se chama Karabiner. Ele tem uma opção chamada Tabmode que permite definir o atalho para alternar aplicativos.
What's Tabmode? It replaces the default shortcut for switching applications. (cmd+tab) While tab is pressed, use your favorite combination of left/right keys to switch between apps. It has evolved into a window manager shortcut, capable of managing windows, tabs, spaces and split views.
Tem opções para alterar o Command-Tab e o Command-Shift-Tab. Se você quiser apenas mudar o Command-Shift-Tab, você terá que criar a opção você mesmo no private.xml. Convenientemente, você pode editar esse arquivo clicando no Open private.xml na guia Musc & Uninstall no Karabiner.
Para ver exemplos de como escrevê-lo, vá para /Applications/Karabiner.app/Contents/Resources e, se você for para include/checkbox/standards/tab.xml dentro de /Resources , encontrará como o Tabmode é escrito para o Karabiner na linha 216. No entanto, é muito mais fácil basta usar os padrões que têm mais do que você poderia querer.