Eu encontrei uma solução por enquanto é simplesmente usar o bootloader padrão do OS X e selecionar 'Windows'. Como tenho o GRUB instalado nessa unidade, em vez de inicializar no Windows, ele me leva ao gerenciador de inicialização do GRUB, onde posso escolher o Ubuntu.
Não é perfeito, pois ainda preciso passar por duas etapas, mas funciona.