até onde eu sei, o chrome usa seu próprio plug-in do Pepperflash, não o próprio Adobe Flash Player (pelo menos no OSX). Você pode procurar essas informações quando acessar esta página:
chrome://flash
e também alterar algumas configurações avançadas em:
chome://flags
Eu gosto da pluma de spray de pimenta, porque você não precisa instalar o flash todas as vezes e está lindamente em sandbox no chrome.
O IE, é claro, precisa voltar ao Adobe Flash Player que está sendo instalado no seu Sistema.