Abra um terminal e emita o comando:
sudo lspci|grep VGA
anote o primeiro endereço de entradas xx: xx.x à esquerda (onde xx: xx.x são os números exibidos)
emita os comandos
sudo cp /etc/X11/xorg.conf /etc/X11/xorg.conf.bak
(para fazer backup de sua configuração atual)
sudo nvidia-xconfig
sudo gedit /det/X11/xorg.conf
(para editar a configuração)
Mover para baixo até a seção "Dispositivo".
Pouco antes da seção final, adicione BusID "PCI:XX:XX.X"
Onde XX: XX.X é o endereço de suas cartas que você anotou antes.
Salve o arquivo, saia e reinicie
Fonte: solução Ryan de comentários com mods menores para backup e clareza