O FCP não suporta o tipo de wrapper MXF por padrão - somente os arquivos MOV serão importados. Há um plug-in de terceiros que oferece suporte a MXF - MXF4MAC - mas eu Não tenho certeza de qual versão você precisaria, e isso pode depender do formato de vídeo dos seus arquivos.
No entanto, se você não tiver esse plugin, você (provavelmente *) não precisará transcodificar seus arquivos de entrada - basta refazê-los.
Antecedentes: MOV e MXF são ambos formatos 'wrapper', em vez de formatos de vídeo / áudio como tal. Eles podem ser "desembrulhados", o que deixaria você com vários arquivos de áudio e vídeo separados, que o FCP poderia importar.
Qualquer transcodificação (recodificação da essência de áudio / vídeo) causará alguma degradação na qualidade da imagem / som, portanto, isso deve ser evitado. Também é um trabalho difícil transcodificar o vídeo, então normalmente leva muito tempo. Um re-wrap pode usar a mesma essência de vídeo / áudio, mas simplesmente empacotá-lo de forma diferente. Pense nisso na mesma linha de pegar um arquivo RAR, extrair os arquivos e depois colocá-los em um novo arquivo ZIP - os arquivos estão completamente inalterados, mas o formato em que eles foram entregues mudou.
Uma maneira (gratuita) de reorganizar arquivos seria usar a ferramenta de linha de comando 'ffmpeg' com o pseudo-codec 'copy' especificado. Sem conhecimento do seu arquivo de entrada, versão do sistema operacional em uso (a ferramenta está incluída na maioria das distribuições Linux, mas está disponível para outras plataformas - faça a sua escolha aqui ), e a versão do ffmpeg está disponível, não posso dar uma linha de comando precisa, mas vai ao longo das linhas de:
ffmpeg -i MyFile.mov -c:a copy -c:v copy MyFile.mxf
Espero que isso ajude - se você precisar de mais detalhes, precisaríamos de mais algumas informações sobre o arquivo de entrada - a maneira mais fácil de obter essa informação é provavelmente MediaInfo (novamente, gratuito, disponível em todas as plataformas), que pode fornecer todos os formatos de vídeo / áudio internos de maneira fácil de acessar.
* dependendo do formato de vídeo real no arquivo MXF - o FCP suporta a maioria dos formatos de vídeo.