Contanto que você não esteja criando manualmente os números de título, ou seja, 2.1, 2.2 você mesmo e você está deixando o Word cria-los, deve ser uma brisa.
Basicamente, vá para a palavra faixa de opções - > Referência - > Menu do índice - > selecione Automatic Table 1 ou 2.
Se você estiver criando os títulos manualmente, comece a convertê-los para a palavra Estilos de cabeçalho usando uma lista de vários níveis na guia Início - > seção de parágrafo da faixa de opções.
No entanto, a formatação do ToC torna-se complicada e envolve a edição de modelos de estilo, mas isso deve ser o último:)