Finnaly Eu consegui encontrar uma solução, como é descrito aqui:
Estou executando o eclipse no Ubuntu 12.04 e gostaria de alterar a cor de saída do console. Tentei editá-lo por meio de Preferências > Executar / Depurar > Console > Cor de segundo plano, mas não funciona. Existe alguma outra maneira de mudar?
Finnaly Eu consegui encontrar uma solução, como é descrito aqui: