Uma solução para o seu problema é configurar o mysql como um serviço. No tarball de instalação do mysql, deve haver um script chamado mysql-server (ou algo similar). Copie isso para /etc/init.d e chame-o de mysql (talvez seja necessário editá-lo, para que o usuário mysql seja o mesmo que você configurou em seu sistema e que o caminho para o mysql seja o mesmo que o do seu sistema sistema). Depois disso, execute os seguintes comandos:
# chkconfig --add mysql
# chkconfig mysql on
Você poderá então gerenciar o mysql usando o comando service , por exemplo,
service mysql start
service mysql stop
service mysql status
Espero que isso ajude!