Tente usar o CCleaner .
Você pode navegar para o > Ferramentas > Drive Wiper no CCleaner e limpar a unidade flash. Configure-o para limpar toda a unidade, defina-a para quantas passagens desejar (apenas uma está bem) e seja absolutamente, completamente certo para selecionar a unidade certa.
Depois disso, formate-o pressionando Tecla Windows + E para abrir o Explorer e clicando com o botão direito do mouse (Formatar ...) no menu de contexto. Defina como padrão e você está pronto para ir.
Esteja ciente de que todas essas operações levarão um tempo considerável e que seus dados serão irrecuperáveis. Se você precisar salvar algo da unidade flash primeiro, será um pouco mais complicado, mas não impossível de gerenciar.