Em vlc, vá para a tela Preferences ( CTRL + P ), então à esquerda há um botão chamado Interface que mostra um Look and feel grupo de opções, contendo uma caixa de seleção Pause playback when minimized : confira!
Ele será reproduzido / pausado automaticamente quando você alternar de / para o espaço de trabalho. Melhor, se você tiver uma tela dupla, mesmo se você trabalhar na outra tela, ela continuará a reproduzir o vídeo até que você mude a área de trabalho onde a vlc está.
Em outras palavras, ele reproduzirá o vídeo somente quando a vlc estiver visível, assim que a vlc estiver oculta, o vídeo será pausado.