Ubuntu 12.04
Parece que isso pode não ser mais possível, mas o que pode funcionar para você é usar Alt + '(tecla grave) para alternar entre as janelas. Para que isso mostre todas as instâncias de um programa, você deve desmarcar o viés de viewport no Gerenciador de Configurações do CompizConfig. (Instale o CCSM se você ainda não tiver)
Para remover o preconceito da área de trabalho -
- Iniciar o CCSM
- Clique no plug-in do Ubuntu Unity
- Clique na guia Alternador
- Desmarque
Bias alt+tab to prefer windows on the current view port