A velocidade do ventilador é conectada ao calor, que é conectado ao consumo de energia. Se a CPU e a GPU acordarem menos, o consumo de energia e o aquecimento gerado serão menores e a ventoinha funcionará menos.
Eu corri powertop no meu laptop e na última aba (tunables) tente mudar os valores para "Good" (tecla enter). Se isso funcionar, os efeitos desaparecerão após a reinicialização. Você deve criar um script baseado nesses ajustes e colocá-lo em /etc/rc.d/rc.local
Para executar os comandos, execute "powertop --html" e ele gerará um arquivo HTML informando quais comandos você pode executar para reduzir o consumo de energia.