De acordo com o artigo Macworld , os verificações do Gatekeeper só se aplicam a aplicativos baixados da Internet (e isso, eles realmente significam aplicativos baixados via Safari, Mail, Chat e outros aplicativos ou aplicativos selecionados que usam frameworks comuns). De acordo com o artigo, a implementação subjacente ainda depende do sistema de Quarentena de arquivos da 10.5.
Com base na sua descrição, o aplicativo não foi colocado em quarentena no sistema e não foi movido para o novo sistema por meio de um aplicativo que aciona uma verificação do Gatekeeper e é por isso que você não tem problemas para abri-lo.