Até onde eu sei, o Windows não pede a sua permissão e corta o acesso à rede o tempo todo quando o computador entra no modo de suspensão. Se o aplicativo de leitura de PDF o mantém na memória quando ele deixa de ser acessível, e se / como ele é recarregado quando a conexão está de volta, tudo depende apenas do aplicativo PDF, acredito.
Portanto, se você não encontrar nada relacionado a isso nas configurações do Acrobat, experimente alguns outros aplicativos de leitura de PDF. O Adobe Reader, o add-in do Adobe Reader para Firefox, o leitor de PDF integrado no Google Chrome e o Nitro PDF são alguns dos que posso imaginar.
Se todos eles tiverem esse comportamento irritante, há uma solução simples: fuja do problema dizendo ao seu computador para não dormir, mas apenas desligue a tela. Isso não deve lhe dar problemas.
Ou, como alternativa, você pode baixar temporariamente uma cópia do arquivo PDF para o seu computador quando for lê-lo. Então, isso não pode ser afetado por problemas de rede.