Não, não há diferença. O método no tutorial extrai e prepara os mesmos arquivos que estariam no ISO (tente navegar na estrutura de pastas do ISO, seria idêntico).
Para obter o boot do ISO do Win7, ele pode ser baixado da Microsoft ou criar um por mim como this tuturial . Supondo que ambos sejam da mesma versão, existe alguma diferença na instalação entre eles? ?