No Fedora você pode instalar um conjunto mínimo, mas esse é muito mínimo (apenas o suficiente para instalar coisas e se mover um pouco). Eu suponho que você realmente quer dizer instalar apenas o que você está usando, e isso dependerá muito de você. O que eu faço quando estou absolutamente entediado é obter uma lista de pacotes instalados e verificar se algo não soa familiar.
O comando package-cleanup (do yum-utils) tem opções para encontrar folhas (pacotes que não dependem de outros), passar por elas, "yum apagar" o que você não precisa, enxaguar e repetir. / p>
Sua pergunta me fez lembrar de uma ferramenta de aeons back ... o pacote rpmorphan contém o rpmusage, que fornece dados detalhados (pode pedir pacotes que não foram usados em X dias, e assim por diante).