Eu acho que você pode verificar o bind-address e editar o arquivo global my.ini, na seção [mysqld]:
[mysqld]
- várias outras configurações
port = 3306
bind-address = 127.0.0.1
Salve este arquivo e, em seguida, reinicie o serviço mysql com o comando:
service mysql restart
Editar
Para conceder acesso a um usuário a partir de um IP remoto, execute este comando a partir do mysql > shell quando logado com o usuário root do MySQL:
GRANT ALL on somedb.* to [email protected] identified by 'somepassword';
Se você deseja conceder acesso a algum usuário de qualquer IP remoto:
GRANT ALL on somedb.* to someuser@% identified by 'somepassword';
Após essas etapas, certifique-se de reiniciar o servidor MySQL para que ele leia as alterações na configuração.