Comecei a ter o mesmo problema com o Google Chrome hoje mesmo (no Ubuntu 16.04).
Alternar entre as guias na mesma janela do Chrome é rápido (assim como o normal).
Tentar mudar o foco de uma janela do Chrome para outra janela do Chrome é dolorosamente lento (como atraso de 2 segundos). Da mesma forma lento ao alternar de uma janela do Chrome para outro aplicativo (por exemplo, nautilus), mas parece um pouco menos lento (como atraso de 1 segundo).
Alternar entre outras janelas sem cromo é a velocidade normal. O Firefox está bem.
A única coisa que mudou para mim é: meu Dell Precision m3800 de repente acha que estou conectado a um adaptador de energia de baixa potência (já experimentei vários adaptadores autênticos da Dell, o mesmo problema).
Normalmente, o Dell BIOS reduz o seu CPU para 800mhz neste estado, e eu acabei configurando intel_pstate = disable processor.ignore_ppc = 1 na minha configuração do grub para forçá-lo a ignorar isso (por Ubuntu 15.04 com intel_pstate - baixa frequência da cpu atual ).