Não existe realmente um layout "físico" ou "RDP", ou um layout "seguindo" outro. Existem apenas resoluções de tela diferentes, cada uma com suas próprias posições de ícone armazenadas no registro em:
HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\Shell\Bags\Desktop
Por exemplo, se sua tela (seja RDP ou física) for 1280x1024, as posições serão armazenadas no valor ItemPos1280x1024(1)
. Exclua e os ícones serão colocados nos locais padrão.