Você pode tentar executar sua área de trabalho real em uma sessão do Xnest e colocar a janela do Xnest no local correto do seu servidor X11 global.
Isso também pode ser automatizado com scripts de shell para iniciá-lo quando você faz o login. A desvantagem é que você perderá alguns dos recursos do servidor X11: O Xnest não é muito acelerado.