Isso pode acontecer porque você configurou os itens de login ou algum outro aplicativo (ex: iCal) está iniciando o Mail.app
há uma discussão detalhada aqui: link
Espero que ajude.
Mail.app continua abrindo quando meu Mac Mini acorda ou inicia após desligar e lembrar de abrir janelas, mesmo que eu não tenha aberto antes de dormir ou desligar.
Alguém mais está experimentando isso? Se sim, como você resolveu isso?
Isso pode acontecer porque você configurou os itens de login ou algum outro aplicativo (ex: iCal) está iniciando o Mail.app
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Espero que ajude.