Eu configurei as contas enquanto estava off-line e copiei a pasta Mail. No Ubuntu, a pasta relevante será algo como /home/g/.thunderbird/abcde123.default/Mail em que g é o seu nome de usuário, e abcde123 é uma hashtag (o nome da pasta padrão pode ser algo diferente) . Eu então reconectar à internet e baixei e-mail.
Infelizmente, o e-mail não foi transferido para a caixa de entrada "Pastas locais" e há uma árvore adicional de pastas para a conta principal.