eu acho que o ecb file browser é apenas um wrapper para dired .. nesse caso, dê uma olhada no seu Variável 'dired-omit-files' usando 'C-h v'. Eu tenho o meu set como
"^\.?#\|^\.$\|^\...+$"
que omite arquivos temp emacs, o link (sem sentido) para o diretório atual e, finalmente, todos os arquivos que começam com '.', tendo em mente não remover o link útil '..'. então tente,
M-: (setq dired-omit-files "^\.?#\|^\.$")
.. e veja se isso faz o truque para você. se assim for, coloque-o no seu .emacs (sem o M -:)