Ah, o Photoshop não salva suas alterações no Espaço de Trabalho ao sair, você tem que explicitamente dizer para salvá-las.
Como você faz isso?
Primeiro, defina tudo como quiser. Em seguida, selecione Workspace
> %código%. Isso salvará seu layout atual no nome da área de trabalho que você fornece.
Se você deseja atualizar um espaço de trabalho existente, faça o mesmo, mas insira o nome do espaço de trabalho que deseja atualizar. Em seguida, selecione "Sim" para substituir as configurações existentes. Um pouco chato, mas lá vai você.