Eu tenho uma solução para o seu problema.
Primeiro, instale o Gerenciador de configurações do CompizConfig se ainda não tiver:
sudo apt-get install compizconfig-settings-manager
Execute o traço ou o terminal digitando ccsm
.
Vá para "Gerenciamento de janelas > Mover janela" ou apenas digite a janela de movimentação no texto de entrada do filtro.
Agora você está lá, altere o valor de "Incremento de movimento do teclado" para a quantidade de pixels que você deseja que as teclas sejam movidas a cada vez (observe que o máximo é 250).
Btw, outra dica: se você estiver usando um teclado com teclado numérico, você pode usar cntrl + alt + qualquer número do teclado; e você verá como as janelas têm um layout de grade sendo o teclado a grade. Isso é muito útil para eu mover e exibir várias janelas.
(Nota: testado no Ubuntu 14.04 e Ubuntu 15.10 e Ubuntu 16.04)