Se você estiver usando o KDE, um lugar para começar pode ser SystemSettings > Input Devices > Mouse > Advanced
e alterar a aceleração do ponteiro.
Se isso não ajudar, tente copiar /usr/share/X11/xorg.conf.d/50-synaptics.conf
para /etc/X11/xorg.conf.d
e, em seguida, editar os parâmetros. Pode até haver alguns parâmetros que não estão no arquivo padrão.
O seu pode não ser um dispositivo Synaptics, mas pode haver arquivos de configuração mais apropriados em /usr/share/X11/xorg.conf.d
que você pode experimentar.
Você terá que reiniciar o X antes que as alterações entrem em vigor.