Você pode alterar o local da pasta Meus documentos no Windows para D e mova todos os seus arquivos pessoais para lá.
No Windows 7 (e possivelmente no Vista), você pode adicionar pastas às suas Bibliotecas e altere seus locais de salvamento padrão para pastas na unidade D.
Não se esqueça de verificar não apenas a porcentagem usada das unidades, mas também a capacidade total antes de fazer isso. Há pouco uso para mover as coisas se a unidade D for muito pequena.