pare o torrent, mova o arquivo manualmente, edite o local do arquivo clicando com o botão direito do mouse no torrent e em Avançado - > Defina o local de download… e force a verificação ou use a opção automática 'mover arquivos quando concluída'.
No Vuze você pode clicar com o botão direito em um arquivo completo e movê-lo para outro lugar. Ele continuará a semear depois de ter sido movido. Pode algo assim ser feito no utorrent?
pare o torrent, mova o arquivo manualmente, edite o local do arquivo clicando com o botão direito do mouse no torrent e em Avançado - > Defina o local de download… e force a verificação ou use a opção automática 'mover arquivos quando concluída'.