Isso realmente depende do que você está fazendo. Para o uso normal da área de trabalho (alguns documentos, imagens, filmes, arquivos de música), a partição 1TB ext3 é perfeita sem nenhuma configuração personalizada.
Se você planeja ter algo mais complicado (número realmente grande de arquivos, por exemplo, com backuppc ou determinados softwares de processamento de dados) pode ser uma boa ideia definir uma quantidade maior de inodes.
O parâmetro -N para mkfs.ext3 permite alterar o número de inodes, mas apenas durante a criação do sistema de arquivos, e não depois:
-N number-of-inodes
Overrides the default calculation of the number of inodes that should be reserved for the filesys-
tem (which is based on the number of blocks and the bytes-per-inode ratio). This allows the user
to specify the number of desired inodes directly.