É muito improvável que isso seja atividade de vírus. Além disso, não é comum segmentar especificamente uma pasta.
Eu recomendaria executar uma verificação do sistema de arquivos em seu disco rígido apenas para garantir que nenhum outro arquivo esteja corrompido, mesmo que eu não ache que seja o problema.
No que diz respeito aos arquivos danificados, há pouco que pode ser feito para recuperar imagens e vídeos danificados. Se você ainda não tem a fonte (eu suponho que era um cartão de memória de uma câmera), e você não tem nenhum backup, você pode estar sem sorte.
Por que vale a pena, eu tive fotos corrompidas no cartão de memória da minha câmera, que obviamente são carregadas como corrompidas para o meu computador, e não há chance de recuperação porque o problema estava no próprio dispositivo.
Boa sorte!