Acho que é aqui que alguém pergunta por que você não está mantendo suas versões em sincronia? Mesmo se você obtiver versões diferentes de seus diretórios .gnome2, você terá diferentes versões de outros programas e eu acho que você corre um grande risco de diferentes versões de programas tendo problemas com as opções de arquivos de configuração mais recentes.
Você precisa ter várias versões para testes ou algo assim?