Este pequeno script do Dtrace registrará facilmente todas as exclusões de arquivos no sistema:
dtrace -qn 'syscall::unlink*:entry { printf("%d, %s, %s\n", uid, execname, copyinstr(arg0));}
syscall::fsat:entry /arg0 == 5 / { printf("%d, %s, %s\n", uid, execname, copyinstr(arg2));}'