Em termos de desempenho, se a especificação for a mesma em velocidade, você verá apenas uma diferença ao executar tarefas de alto nível que exigem muita memória.
Quanto à velocidade para a memória DDR2, não podemos realmente comparar sem outros fatos, como a velocidade da memória e a latência.
Aqui está um teste básico da Anandtech que mostra vários módulos de memória comparados - você pode ver que o desempenho em a maioria é apenas marginalmente diferente em algumas situações.