Você já tentou usar links simbólicos ou até mesmo aliases criados no Finder?
A idéia é que você crie sua pasta "Projects" e, dentro dessa pasta Projects, poderá ter uma pasta para cada projeto. Cada pasta do projeto teria um alias para a pasta na sua pasta ~/Sites
e um alias (ou você apenas moveria os arquivos) para a pasta de recursos do projeto.
Os aliases podem ser criados clicando em uma pasta e escolhendo "Criar alias" no menu Arquivo. (Comando - L ). Links simbólicos precisam ser criados na linha de comando ou usando um plugin para o Finder . Para facilitar as coisas, eu recomendo colocar essa pasta Projetos na sua barra lateral também.
ln -s /PATH/TO/SRC /PATH/TO/DESTINATION/