Você verificou o sistema de arquivos / hardware? Se você estiver inicializando no modo de segurança e ainda tiver um problema Utilitário de Disco - > Verifique o disco.
Reinicie também com os discos do sistema e mantenha pressionado 'd' nos macs mais novos e execute a verificação de hardware.
Parece que o armazenamento em cache na inicialização está causando um problema, seja o sistema de arquivos ou o SO é difícil de dizer.