Primeiro você deve tentar usar o TestDisk na sua chave usb, se for bem sucedido, você terá suas partições de volta. A maneira como funciona é verificando o volume e tentando encontrar marcadores de suas partições antigas e recriá-las.
Caso isso não funcione, você sempre pode * obter seus dados de volta usando PhotoRec , que pesquisa seu volume por magic numbers e arquivos dump que encontra em outro volume.
Ambos são ferramentas livres e de código aberto e funcionam muito bem, se não conseguirem encontrar seus dados, há poucas chances de encontrá-los com outras ferramentas (não que você não deva tentar fazer isso de qualquer maneira).
* "sempre" como em "seus dados não foram sobrescritos pela ferramenta de formatação", as opções de "formato rápido" no Windows apenas tocam no setor de inicialização .