O Ubuntu funcionará. Mas algumas coisas você precisa considerar:
- o driver da placa de vídeo. Se você for da nVidia para a AMD ou vice-versa, remova o driver do sistema antigo e reinstale-o quando o disco estiver inserido. O
- indo de um sistema de 32 bits para um de 64 bits funcionará, mas a reinstalação pode ser melhor (para que você obtenha o benefício de 64 bits). O contrário (64- > 32) ... simplesmente não.